故事旁白从雷克斯·路瑟(sè)开始，描述超人所作的英雄事迹及形象(xiàng)雷克斯描述超人作为一个地球(qiú)上的神，但坚持说“该来的时候(hòu)，甚(shén)至是神也必须(xū)要死”。　　露易丝·莲(lián)恩(ēn)和超人正在浪(làng)漫(màn)的约(yuē)会(huì)，但露意丝对他们的关系安(ān)排(pái)并不满意。超人坚持认为，两人的关系只能隐(yǐn)密(mì)地在孤独堡垒中度(dù)过。他还没有向(xiàng)他透露自己真实身份是克拉克·肯(kěn)特(tè)，尽(jǐn)管露意丝已经开始怀(huái)疑。　　另一方面雷克斯公司挖掘到一艘(sōu)太空船，当工人正在执(zhí)行挖掘的工作时不小心将基(jī)因改(gǎi)造的凶(xiōng)残怪物(wù)末日杀手释(shì)放(fàng)。末日杀手将工人们全数杀害(hài)后一步步走(zǒu)到了都市，一路上将鹿(lù)、狗、狗的主(zhǔ)人全都杀死。横(héng)冲(chōng)直撞的末日杀手到达(dá)大都市后随(suí)即被超人发现，两人并展开大战。最(zuì)后超人全力抓(zhuā)着它(tā)从高空直落撞击地面，露易丝与同事吉米·奥(ào)尔(ěr)森(sēn)告诉受重伤的超人已成功(gōng)打倒敌(dí)人，但超人也因受伤过重而断了气。　　世界(jiè)集体哀(āi)悼(dào)他们倒下的英雄，并在公园(yuán)建(jiàn)立了超人的纪念碑。后来雷克斯将他的女助理(lǐ)一枪杀死以确保再也没人知(zhī)道雷克斯公司和末日杀手的出现有关。后来吉米对超人的死相当难(nán)过，意外地到了其他大间的报社上班。超人死后，犯(fàn)罪(zuì)率(lǜ)增(zēng)加(jiā)，玩具人操(cāo)控著(zhù)巨(jù)大机械(xiè)蜘(zhī)蛛(zhū)并挟(xié)持了一辆(liàng)戴满小孩的校(xiào)车(chē)在屋(wū)顶上，露易丝决定将人质救出，便独自前往，但在遇(yù)到危机时，超人意外地及时出现制伏(fú)了玩具人。露易丝开心地和复活的超人一吻，后来超人的养母玛(mǎ)莎感到质疑为什(shén)么他没有打电(diàn)话回家，露易丝也认为超人有点(diǎn)奇怪。　　后来透露其实复活的超人是雷克斯制造的克隆人，雷克斯在超人与末日杀手一战时采(cǎi)集了前者的血液(yè)，因此复制超人只听命(mìng)于雷克斯。后来雷克斯将复制超人引到了一间有红(hóng)色太阳光(guāng)的房(fáng)间，并戴上氪石的手套(tào)不断打击他藉(jí)以发泄。打完(wán)后雷克斯便前去看他私自挖出的超人本(běn)尊(zūn)尸(shī)体。但实际上超人还活着，并偷偷地被超人的机器人助手移到孤独堡垒中恢复。　　复制超人在看到逃(táo)狱(yù)后的玩具人杀死了一名4岁(suì)的女孩的报导(dǎo)时，性(xìng)格(gé)突然变得灰(huī)暗(àn)，即刻(kè)前去把(bǎ)玩具人杀掉，此作法使得周(zhōu)遭的人感到奇怪，警(jǐng)察(chá)也开始追(zhuī)捕他，露易丝认为他不是真的超人。后来露意丝和吉米发现了雷克斯想要复制超人大军的计划(huà)，在雷克斯正打算将两人解决时，突然复制超人出面帮助了两人且(qiě)还将所有的复制超人试(shì)管全数破坏，因为复制超人自行将自己体内(nèi)含(hán)铅(qiān)的氪石拿(ná)出使得雷克斯无(wú)法控制他。　　另一方面真正的超人在机器人助手的帮助下渐渐恢复力量，但后来听到有关军队和复制超人开战的消息便即时前往，但因力量只恢复了六成，机器人给他穿(chuān)上了黑(hēi)色的太阳超人装(zhuāng)并将氪石枪交(jiāo)给超人。后来超人便和复制超人展开对战，超人的氪石枪被打飞(fēi)至远处，超人持续(xù)处于下风，露易丝将氪石枪捡(jiǎn)起并打算射复制超人时被对方破坏了枪，但氪石罐掉了出来。复制超人在石油地打倒超人时将一旁的纪念碑举(jǔ)起打算了结(jié)对方，超人用热(rè)力射线(xiàn)将黏于复制超人胸(xiōng)口(kǒu)的氪石罐打破冒(mào)出了大量的氪气体，复制超人因此败北(běi)。临(lín)死前，他告诉超人要保护人民(mín)。露易丝确定了他是真正的超人并亲(qīn)吻了他，同时也赢(yíng)得大家的信(xìn)赖。　　超人在露易丝的公寓(yù)，发现她(tā)的文(wén)章(zhāng)“复活”拼(pīn)错，并戴上眼(yǎn)镜证明自己就(jiù)是克拉克，露易丝便高兴地拥(yōng)抱(bào)他。在雷克斯公司，雷克斯先(xiān)前被复制超人打成重伤，但仍活着叙(xù)述历史(shǐ)已经证明，神可以死，但他们还可以回到从死里(lǐ)复活。他对自己微笑(xiào)、沉(chén)思，可能又再想要如(rú)何(hé)摧毁(huǐ)超人。